Deutschland gegen Ende des Zweiten Weltkrieges: Der kleine Johannes „Jojo“ Betzler (Roman Griffin) ist ein überzeugter Nazi. So überzeugt sogar, dass sein imaginärer Freund niemand Anderes als Adolf Hitler (Taika Waititi) höchstpersönlich ist. Doch trotz seinem Eifer für die Ideologie des Dritten Reichs kann Jojo sich bei einem Trainings-Camp der Hitlerjugend nicht beweisen und wird bei einem Unfall mit einer Handgranate schwer verletzt. Zurück zu Hause kümmert sich seine Mutter Rosie (Scarlett Johansson) zwar liebevoll um ihn, doch in den vielen einsamen Stunden macht Jojo schließlich eine schockierende Entdeckung: Seine Mutter hat einem jüdischen Mädchen namens Elsa (Thomasin McKenzie) in ihrem Haus Unterschlupf gewährt. Durch den Kontakt mit Elsa geraten Jojos Überzeugungen langsam, aber sicher ins Wanken…